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benenen12345
アクチンのN末端のアルギニン化の機能と構造への影響 アルギニン化による重合活性や線維構造、細胞導入時の細胞生存率への影響はほとんどないものの、ミオシンの親和性低下や、Arp2/3複合体に依存する細胞内構造形成能の減少などが確認された #BNTNJC rupress.org/jcb/article/225/…
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β-cyclodextrin retweeted
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光を利用したタンパク質精製方法の開発 光異性化によってα-シクロデキストリンへの結合親和性が切り替わる短いペプチドをタンパク質と融合させて達成 様々なタンパク質のアフィニティー精製を溶液組成を入れ替えることなく達成できた #BNTNJC nature.com/articles/s41467-0…
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古細菌による遺伝暗号の拡張 系統的に離れた古細菌において、本来は終止コドンのTAGが21種類目のアミノ酸ピロリシンのコドンとして利用されていた ピロリシンは1800種以上のタンパク質に含まれ、この古細菌システムによるピロリシン類自体の大腸菌への導入もできた #BNTNJC science.org/doi/10.1126/scie…
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細胞内部に膜区画構造を持つ古細菌の単離 真核生物と最も近縁であるとされるHeimdallarchaeiaの新種を単離 培養後期では細胞骨格とともに細胞の突起構造が観察される一方で、培養初期では細胞内に小胞のような構造が形成されることを示した #BNTNJC biorxiv.org/content/10.1101/…
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緑膿菌バイオフィルムをかいくぐって感染するファージの進化的獲得 定向進化実験により、肺を模した環境でバイオフィルムを形成した緑膿菌にも感染可能なファージを獲得 尾部および基盤部形成タンパク質がファージの感染性向上に関わっていた #BNTNJC nature.com/articles/s41467-0…
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ミオシンVをATP非依存的に歩かせる ADP存在下で停止中のミオシンVの後方の頭部ドメインに高速AFMのプローブで強く力を掛けると、アクチン線維から後方の頭部ドメインが解離して一歩前進した 前方の頭部ドメインの歪みで発生したエネルギーで前進できるのだとのこと #BNTNJC biorxiv.org/content/10.1101/…
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Chidambara .ML. retweeted
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中間径フィラメントの力学特性に関する総説 非常に強力な弾性や、ネットワーク形成により核など小器官のクッションのように働く性質、力の方向に伴った膜への配向、二価カチオンによる束化を可能にする表面電荷の性質などが紹介されている #BNTNJC sciencedirect.com/science/ar…
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細胞骨格のクロストークに関する総説 細胞の変形や収縮、極性化、接着、運動などの過程でアクチン線維、微小管、中間形繊維が協同する様子を生細胞および再構成系で研究された例が統合的に紹介されている #BNTNJC doi.org/10.1063/5.0198119
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グラム陰性菌の外膜タンパク質の挿入を担うBAM複合体の新規構造 Bacterioidota門では、既知のBamA/Dに加え、新規に見つかったBamG/H/I/J/KがBAM複合体に含まれており、追加のβ-バレル型膜タンパク質と大きなペリプラズム領域を備えた構造を取っていた #BNTNJC nature.com/articles/s41564-0…
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サイズが可変な非ウイルス性カプシドの構築 カプシド様に会合するタンパク質のドメインを分割して調製し、mRNAや正に強く帯電した蛍光タンパク質など様々な物質を内包する系を構築した DNAオリガミを内包させることで、会合体のサイズ増加や形状変化も可能であった #BNTNJC pubs.acs.org/doi/full/10.102…
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形態形成に関わる新規細菌アクチンの発見 FcmBという糸状のシアノバクテリアに保存されるタンパク質で、プラスミド分配に関わるParMやAlfAと近縁であり、細胞内で重合し、同じく形態形成に関わるMreBCDとは独立に、FcmCと協同して細胞の形態形成にかかわっていた #BNTNJC journals.asm.org/doi/10.1128…
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アクチン繊維末端の揺らぎ 重合が定常状態に達した時、アクチン線維は反矢じり端にて、2種類の異なる頻度でサブユニットを入れ替える温和な動的不安定性を示した この現象はファロイジンやキャッピングタンパク質などで阻害され、ATPの約3分の1を消費するとのこと #BNTNJC pnas.org/doi/10.1073/pnas.25…
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benenen12345
キネシン尾部の輸送物質結合タンパク質との結合状態での構造解析 アダプタータンパク質KAP3との境界に、KIF3Aと輸送物質結合タンパク質APCとの特異的な結合領域が形成され、神経軸索での物質輸送においても重要な役割を果たすことを示した #BNTNJC science.org/doi/10.1126/scia…
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細胞分裂に必須な細菌チューブリンFtsZとその関連タンパク質ZapCの結合解析 ZapCはFtsZの球状ドメインと構造を取らないC末端領域に結合し、FtsZ繊維を束化させることを示した #BNTNJC journals.asm.org/doi/10.1128…
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真核生物の直接起源とされるアスガルド古細菌のヌクレオソーム構造 高Mg濃度では他の古細菌でも確認されるようなコンパクトにまとまった構造を取る一方、低Mg濃度では真核生物で確認されるような開いた構造を取っていた #BNTNJC cell.com/molecular-cell/full…
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グラム陰性菌の外膜タンパク質の挿入を担うBAM複合体の新規構造 Flavobacterium属では、既知のBamA/Dに加え、新規に見つかったBamG/H/M/PがBAM複合体を構成していた 新規タンパク質は生存に必須かつ近縁種に保存されており、Darbobactin耐性に関わるだろうとのこと #BNTNJC nature.com/articles/s41586-0…
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高効率なタンパク質間相互作用予測による生合成遺伝子クラスターのネットワーク解析 AlphaFold3の多重配列アラインメントをMMSeqs2に置き換えることで、約50万組のタンパク質ペアから、機能未知タンパク質も含む約15000組の信頼性の高いヘテロマー相互作用を予測した #BNTNJC biorxiv.org/content/10.1101/…
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植物胚軸の過重力応答における微小管切断タンパク質の役割 過重力環境においてシロイヌナズナ胚軸の細胞は表層微小管を横向きに再配向して太く短くなる一方、微小管切断タンパク質のカタニンの変異体ではその過重力応答が抑制された #BNTNJC sciencedirect.com/science/ar…
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